رفض زعيم تنظيم القاعدة، أيمن الظواهري، الاعتراف بشرعية تنظيم الدولة الإسلامية "داعش" وزعيمها أبو بكر البغدادي غير أنه قال إنه لو كان في العراق أو سوريا لتعاون معهما ضد التحالف الذي يقوده الغرب.

وفي تسجيل صوتي على الانترنت قال الظواهري "لا نعترف بهذه الخلافة ولا نراها خلافة على منهاج النبوة بل هي إمارة استيلاء بلا شورى ولا يلزم المسلمين مبايعتها ولا نرى أبا بكر البغدادي أهلا للخلافة".