رحب مجلس أمناء جامعة النيل بالقرار الجمهوري الذي أصدره الرئيس المؤقت المستشار عدلي منصور بتحويل جامعة النيل إلى جامعة أهلية تحت مسمى "جامعة النيل الأهلية"، تكون لها الشخصية الاعتبارية، ويكون مقرها محافظة الجيزة، وتُباشر نشاطها طبقاً لأحكام قانون الجامعات الخاصة والأهلية الصادر بالقانون رقم 12 لسنة 2009 ولائحته التنفيذية والقوانين الأخرى ذات الصلة. وصرح رئيس جامعة النيل الدكتور طارق خليل بأن قرار رئيس الجمهورية جاء ليعيد الحق إلى أصحابه وينهي فترة 3 سنوات من الصراع والنزاع. وأثنى الدكتور طارق خليل على دور رئيس مجلس الوزراء المهندس إبراهيم محلب في تنفيذ وعده بعد زيارته السابقة للجامعة بشأن احترامه لأحكام القضاء وتنفيذها.. وأنه سيسعى جاهدا لإيجاد حل يضمن استمرارية جامعة النيل واحترام حقوق الطلبة والأساتذة في أسرع وقت.. وأشار رئيس الجامعة أنه بهذا القرار تنتقل كل حقوق والتزامات جامعة النيل الخاصة إلى جامعة النيل الأهلية.